Минуло два роки після вторгнення тендосю на центральний термінал О-Едо. Відтоді Йорозуя розійшлися. Передбачаючи повернення Уцуро, Ґінтокі Саката починає досліджувати лей-лінії Землі на пошук слідів Альтани іншої людини. Після зіткнення з залишками Тендосю, які продовжують наполягати в пошуках безсмертя, Ґінтокі повертається до Едо. Пізніше перегруповані Сінсенгумі та Йорозуя починають атаку на окупований Центральний термінал. Оскільки Альтана, зібрана уламками корабля Тендошу, знаходиться під загрозою детонації, Йорозуя та їхні союзники борються з ворогами, поки безпека Едо та решти світу висить на волосині. Виконуючи побажання свого вчителя, колишні учні Шуйо Йошіди об’єднуються й знову переживають своє минуле востаннє, намагаючись врятувати своє майбутнє.